复旦大学与上海交通大学都是我国顶尖的高等学府，在普外（普通外科）领域均有卓越的研究和教学实力。选择哪个更好，主要取决于以下几个方面：
1. 学科排名：复旦大学在普外领域的学科排名较为靠前，尤其在基础研究和临床教学方面有深厚的底蕴。
2. 师资力量：上海交通大学在普外领域的师资力量同样雄厚，临床实践经验丰富，尤其在微创外科领域有显著成就。
3. 研究方向：复旦大学在普外基础研究方面更为突出，而上海交通大学在临床应用和微创技术方面更具优势。
4. 就业前景：两校的毕业生在国内外均有良好的就业前景，但具体选择还需结合个人职业规划。
综合来看，复旦大学与上海交通大学各有特色，具体选择哪个还需根据个人兴趣和职业规划来决定。
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